ChIP-seq技术服务
ChIP-seq(Chromatin immunoprecipitation and high-throughput sequencing,ChIP-seq)是研究体内蛋白质与DNA相互作用的有力工具,利用该技术不仅可以检测体内反式因子与DNA的动态作用,还可以用来研究组蛋白的各种共价修饰以及转录因子与基因表达的关系。
ChIP的原理是:在生理状态下把细胞内的DNA与蛋白质交联在一起,通过超声或酶处理将染色质切为小片段后,利用抗原抗体的特异性识别反应,将与目的蛋白相结合的DNA片段沉淀下来。染色质免疫沉淀技术一般包括细胞固定,染色质断裂,染色质免疫沉淀,交联反应的逆转,DNA的纯化及鉴定。
生物信息学分析
ChIP-seq技术服务样品要求
1、目的基因或转录因子的相关背景资料;
2、ChIP检测专用抗体(或者由钟鼎提供抗体定制服务)
3、细胞:细胞数大于2×107个,1%甲醛固定细胞后,PBS清洗细胞3次,离心收集细胞沉淀,液氮速冻,-80℃保存,干冰运输。
组织:动物不少于400mg,植物不少于2g,离体后迅速超低温处理并-80℃冻存的组织样品,干冰运输。
ChIP-seq技术服务报价
染色质免疫共沉淀技术服务 | |||
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服务项目 | 项目内容 | 起始材料 | 交付产品 |
ChIP-qPCR | ChIP实验 qPCR检测 |
蛋白信息(物种、序列) 蛋白抗体 细胞样品 待测基因信息(物种、序列) |
实验报告 qPCR结果 所有结果原始图片 |
ChIP-seq | ChIP实验 高通量测序 |
蛋白信息(物种、序列) 蛋白抗体 细胞样品 |
实验报告 高通量测序结果 所有结果原始图片 |
ChIP测序服务需知:
1、如果有对应蛋白的商业化抗体,最好是通过染色质免疫共沉淀ChIP验证的,否则我们无法确认实验结论的可靠性,此商业化抗体需客户自购或委托钟鼎生物购买。如果需要重新转染细胞引入新的蛋白,则需客户提供表达载体和对应的宿主细胞。
2、我们一般使用重组蛋白的抗体或抗RNA聚合酶II的抗体作为阳性对照,使用与ChIP抗体同物种的IgG作为阴性对照,如果需要其他的抗体作为对照,需客户自行提供。
3、我们提供完整的实验报告、有代表性的照片、测序结果等原始数据,由于ChIP实验的特殊性,我们不承诺实验结论一定与客户预期一致。
部分客户发表文章:
1、MYC2 regulates stomatal density and water use efficiency via targeting EPF2/EPFL4/EPFL9 in poplar
DOI: 10.1111/nph.19531(IF=9.4)
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