文库建立和文库筛选
互作验证
1 诱饵菌株构建
使用BstbI限制性内切酶将4 µg pAbAi重组质粒线性化。
图1. 线性化检测结果:
LineM:1Kb Marker
Line1:为酶切前
Line2:为酶切后
由图1可知c线性化成功,可以进行诱饵菌株构建实验。
2 整合鉴定
图2. 整合鉴定结果:
LineM:2000bp Marker
Line1:阳性对照
Line2:阴性对照
Line3-6:阳性菌株
由图2鉴定结果,pAbAi-peak3诱饵质粒正确整合到Y1H菌株里面,可以进行自激活检测实验。
3 自激活检测
图3.自激活检测结果
自激活检测结果分析:Y1HGold[pAbAi-peak3]在SD/-Ura平板上正常生长,但在SD/-Ura with AbA(100ng/mL)平板上没有生长,所以pAbAi-peak3有自激活,用100 ng/mL AbA进行后续筛选实验。
4 文库筛选
初筛
图4.SD/-Leu with AbA(100ng/mL)初筛图片
二筛
为了去除假阳性,在初筛平板上挑选88个克隆,点板至SD/-Leu with AbA(100ng/mL)平板,进行二次筛选确认。
图5 .SD/-Leu with AbA(100ng/mL)二次筛选图片
二次筛选结果显示:再次划线到SD/-Leu with AbA(100ng/mL)平板上的克隆全部生长,由此可以确认初筛的88个克隆均为阳性克隆。
6 阳性克隆测序
将生长状态良好,且经过复筛的单克隆进行菌落PCR测序,测序结果进行blast比对后最终获得63个克隆。
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