16S rDNA · 26S rDNA D1/D2 区 · ITS 测序 · 16S 高通量测序 · 快速准确鉴定到种
通过 DNA 测序对微生物进行物种鉴定（菌种鉴定）是比传统生化鉴定更先进的鉴定方法。DNA 测序不依赖菌种本身特点，对所有菌种均可使用，比传统生化鉴定更加快速、准确。
钟鼎生物技术公司提供的微生物物种鉴定服务包括 细菌 16S rDNA 鉴定、真菌 26S rDNA 鉴定、真菌 ITS 鉴定，通过 PCR 扩增 16S rDNA 或 26S rDNA 片段，测序后在 GeneBank 或者 EzTaxon 对比即可。一般序列相似度在 97% 以上就可以认为是同种菌种。钟鼎生物技术通过大量实验优化的通用引物适用于 99% 以上的微生物，鉴定成功率在 95% 以上。
DNA 测序不依赖菌种自身生化特点，无论是否可培养、生长快慢，均可进行物种鉴定，覆盖范围远优于传统生化鉴定。
16S rDNA / 26S rDNA / ITS 测序比对，一般序列相似度 97% 以上即可判定为同种，多数样本可鉴定到种水平。
经大量实验优化的通用引物，适用于 99% 以上的微生物样本，鉴定成功率在 95% 以上，减少重复实验。
细菌可选 16S rDNA 部分或全序列、16S 高通量测序；真菌可选 26S rDNA D1/D2 区或 ITS 区，按研究目的灵活选择。
细菌 16S rDNA：16S rRNA 其大小在 1,500 bp 左右，所代表的信息量适中，因此是进行菌种鉴定研究的理想材料。16S rDNA 部分序列鉴定针对 16S rRNA 测序约 500 bp，全序列鉴定针对 16S rRNA 全长测序约 1,500 bp，序列越长分辨力越高。
真菌 26S rDNA：真菌大亚基上的 26S rDNA 分子，可分为 D1、D2…D12 等多个区域，其中 D1/D2 区域序列长度适中，适合于真菌菌种鉴定。常规检测 26S rDNA D1/D2 区片段（约 600 bp）。
真菌 ITS：真菌的 ITS（Internal Transcribed Spacer）基因，包括 ITS1 及 ITS2 两部分，进化速度快，具有多态性，适于对亲缘关系较近的菌株进行区分性的菌种鉴定，扩增片段长度约 300-1000 bp。
| 服务项目 | 服务说明 | 服务价格 | 周期（工作日） |
|---|---|---|---|
| 16S rDNA 部分序列鉴定 | 针对 16S rRNA 测序（500 bp） | 在线询价 | 8 工作日 |
| 16S rDNA 全序列鉴定 | 针对 16S rRNA 全长测序（1500 bp） | 10 工作日 | |
| 真菌 26S rDNA 鉴定 | 26S rDNA D1/D2 区片段测序（600 bp） | 10 工作日 | |
| 真菌 ITS 鉴定 | ITS 区片段（300-1000 bp） | 10 工作日 | |
| 16S 高通量测序 | 百万级别的序列信息 | 10 工作日 |
实验报告：包含 PCR 产物照片、菌种鉴定 NCBI 进化树比对结果、测序彩色峰图、序列碱基报告。
注：对于鉴定的菌株，我们不做备份及保留，请送检之前做好保种工作。
通过 DNA 测序对微生物进行物种鉴定，是比传统生化鉴定更先进的方法。DNA 测序不依赖菌种本身特点，对所有菌种均可使用，且比传统生化鉴定更快速、更准确。常用靶标包括细菌 16S rDNA、真菌 26S rDNA D1/D2 区以及真菌 ITS 区。
细菌 16S rRNA 大小约 1,500 bp，所代表的信息量适中，是菌种鉴定研究的理想材料。真菌大亚基上的 26S rDNA 可分为 D1、D2…D12 等多个区域，其中 D1/D2 区域序列长度适中，适合真菌菌种鉴定。真菌 ITS 基因包括 ITS1 及 ITS2 两部分，进化速度快、具有多态性，适于对亲缘关系较近的菌株进行区分性鉴定。
测序后在 GeneBank 或 EzTaxon 比对，一般序列相似度在 97% 以上就可以认为是同种菌种。个别菌种由于微生物数据库相关数据缺乏，只能鉴定到属。
样品形式可以是新鲜菌液、斜面培养基、平面培养基或者提取好的 DNA。如果样品为基因组 DNA，要求 DNA 浓度大于 20 ng/μL，体积大于 20 μL。对于某些致病性菌体，请提前说明，注意保护工作人员健康及环境卫生。
实验报告包含 PCR 产物照片、菌种鉴定 NCBI 进化树比对结果、测序彩色峰图、序列碱基报告。对于鉴定的菌株，钟鼎生物不做备份及保留，请送检之前做好保种工作。
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