特异性识别磷酸化位点的抗体,是如何制备的?
你正在研究一个崭新的信号通路,文献稀少,你兴奋地设计好实验,却在第一步就卡住了——市面上根本找不到能识别你目标蛋白特定磷酸化位点的抗体。这是许多探索前沿领域的科研人真实的困境。
当通用工具无法满足独特需求,定制便成为破局之道。
以多克隆抗体制备为例,常规抗体制备的流程一般分为抗原设计、抗原制备、免疫动物、收获抗体等步骤。

而磷酸化抗体的制备,其核心在于必须先人工合成“磷酸化多肽”作为抗原,流程自此分岔,并由此带来了三大独特难点:
(1)化学需要合成带磷酸化修饰的多肽作为抗原,这一步本身就很棘手。
(2)免疫动物产生的抗血清是一个混合物,包含我们想要的(只识别磷酸化形式)、不想要的(只识别非磷酸化形式)以及两种都识别的抗体。因此,必须通过复杂的亲和纯化流程才能“淘洗”出高特异性的抗体。
(3)必须通过严谨的实验证明,该抗体只与磷酸化蛋白反应,不与未修饰的蛋白或其他蛋白交叉反应。
下面我们以案例为基础,展示一下磷酸化抗体的制备流程。
1、实验设计
(1) 以目的序列设计免疫用多肽序列,合成非磷酸化多肽和磷酸化多肽,多肽偶联KLH;
(2) 磷酸化多肽免疫2只rabbit;
(3) 磷酸化多克隆抗体纯化
2、多肽合成
2.1、非磷酸化多肽HPLC检测结果
| Sequence: | XXXXXXXXXXXX-C | |
| Column: | 4.6mm*250mm, GS-120-5-C18-BIO | |
| Calculation Type: | Percent | |
| Solvent A: | 0.1% Trifluoroacetic in 100% Acetonitrile | |
| Solvent B: | 0.1% Trifluoroacetic in 100% water | |
| Gradient: | A | B |
| 0.00min 20% | 80% | |
| 25min 45% | 55% | |
| 25.1min 100% | 0% | |
| 30min stop | ||

2.2、非磷酸化多肽MS分析结果
| MW: | 1380.59 | Probe bias: | -3.5kv |
| Probe: | ESI | Detector: | 1.0kv |
| DL: | -20.0v | T.Flow: | 0.2ml/min |
| DL Temp: | 250℃ | B.conc: | 50%H2O/50%ACN |
| Block Temp: | 200℃ |
2.3、磷酸化多肽HPLC分析结果
2.4、磷酸化多肽MS检测结果
| MW: | 1460.57 | Probe bias: | -3.5kv |
| Probe: | ESI | Detector: | 1.0kv |
| DL: | -20.0v | T.Flow: | 0.2ml/min |
| DL Temp: | 250℃ | B.conc: | 50%H2O/50%ACN |
| Block Temp: | 200℃ |
3.纯化抗体效价检测
起始稀释度: 1:500
效价即样品OD/空白OD ≥2.1的最高稀释度
通过ELISA检测结果得出,磷酸化多肽抗体针对磷酸化多肽A效价在512K左右,针对非磷酸化多肽B效价在512K左右。
起始稀释度: 1:500
效价即样品OD/空白OD ≥2.1的最高稀释度
通过ELISA检测结果得出,去除交叉反应的磷酸化多肽抗体针对磷酸化多肽A效价在512K左右,针对非磷酸化多肽B效价在4K左右。
起始稀释度: 1:500
效价即样品OD/空白OD ≥2.1的最高稀释度
通过ELISA检测结果得出,非磷酸化多肽B抗体针对磷酸化多肽A、非磷酸化多肽B效价均在256K左右。
4.纯化后抗体纯度检测
5.结论
通过ELISA检测效价得出,磷酸化多肽抗体针对磷酸化多肽A效价在512K左右,针对非磷酸化多肽B效价在4K左右,纯度在85%以上,获得磷酸化抗体得率达到3.5 mg以上。
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