GST pull-down是体外检测蛋白间直接互作的行之有效的方法,可用于证实预测的蛋白质-蛋白质相互作用的存在,也可用作未知的蛋白质-蛋白质相互作用的初始筛选测定法。
本文以钟鼎生物的典型实验案例为线索,系统讲解GST pull-down的技术原理、实验设计、融合蛋白诱导表达、GST/Ni柱纯化及pull-down实验的完整操作流程,并附实验体系表、速查表与常见问题解答,供实验参考。
本文内容速览:
GST pull-down 实验基于 GST(glutathione-S-transferase,谷胱甘肽-S-转移酶),它可以与谷胱甘肽(Glutathione,GSH)特异性结合。
将GSH固定于琼脂糖珠上,形成GSH-琼脂糖珠;将已知蛋白X与GST融合表达,获得的GST-X可与GSH-琼脂糖珠结合。若环境中存在与X蛋白互作的蛋白Y,则会形成"琼脂糖珠-GSH-GST-X-Y"复合物,与X蛋白互作的蛋白即可被分离并检测。
GST标签与GSH特异结合,诱饵蛋白X与互作蛋白Y结合,形成"琼脂糖珠-GSH-GST-X-Y"复合物。离心收集琼脂糖珠,即可将与X互作的蛋白Y一同分离下来,用于SDS-PAGE或Western Blot检测。
本实验基于钟鼎生物实际案例,验证预测的两个蛋白(A与B)之间的互作。为了区分特异性互作与非特异吸附,共设置4组对照体系:
| 组份 | 1 | 2 | 3 | 4 |
|---|---|---|---|---|
| A-GST | + | − | − | + |
| B-His | − | + | + | + |
| GST | − | − | + | − |
四组对照的作用:
将诱饵蛋白A与GST标签融合(pGEX-4T-1-A),将靶蛋白B与His标签融合(pET28a-B-His),分别通过IPTG诱导表达。
1.1 表达载体转化至大肠杆菌Rosetta感受态。
1.2 挑取转化平板上的单克隆接种于含 50 μg/mL Amp 的3 mL LB培养液的试管中,37℃摇菌过夜,制备种子液。
1.3 次日按 1:100 接种于含50 μg/mL Amp的30 mL LB培养液中,37℃摇至菌体 OD₆₀₀ = 0.8。
1.4 向菌液中加入IPTG至终浓度为 0.5 mM,11–28℃ 摇床培养,诱导融合蛋白表达 4–8 h。
1.5 将菌液离心弃上清,用PBS重悬菌体沉淀,超声波破碎,离心取上清。
1.6 吸取少量上清用于SDS-PAGE检测目的蛋白表达情况。
关键参数汇总:菌体 OD₆₀₀ = 0.8 → IPTG终浓度 0.5 mM → 诱导温度 11–28℃ → 诱导时间 4–8 h。低温诱导是保证融合蛋白可溶性的关键。
采用超声破碎,分别使用GST柱亲和纯化和Ni柱亲和纯化,获得纯化后的目的蛋白。
(1)利用低压层析系统,细胞裂解上清液上样至GST Binding-Buffer预平衡的GST亲和层析柱。
(2)用GST Binding-Buffer冲洗层析柱,至流出液 OD₂₈₀值到达基线。
(3)用GST Elution-Buffer洗脱目的蛋白,收集流出液。
(4)收集的蛋白溶液加入透析袋中,使用Tris-HCl透析过夜。
(5)进行SDS-PAGE分析和WB分析。
(1)利用低压层析系统,细胞裂解上清液上样至Ni-IDA Binding-Buffer预平衡的Ni-IDA-Sepharose Cl-6B亲和层析柱。
(2)用Ni-IDA Binding-Buffer冲洗层析柱,至流出液 OD₂₈₀值到达基线。
(3)用Ni-IDA Washing-Buffer冲洗层析柱,至流出液OD₂₈₀值到达基线。
(4)用Ni-IDA Elution-Buffer洗脱目的蛋白,收集流出液。
(5)收集的蛋白溶液加入透析袋中,使用Tris-HCl进行透析过夜。
(6)进行SDS-PAGE分析和WB分析。
两种纯化方式对比:GST柱利用GST-GSH特异性结合纯化A-GST融合蛋白,洗脱时使用含还原型谷胱甘肽的洗脱液;Ni柱利用His标签与Ni²⁺螯合纯化B-His融合蛋白,洗脱时使用含咪唑的洗脱液。两种标签互不干扰,可分别纯化后再进行pull-down互作检测。
使用 GST Protein Interaction Pull-Down Kit(购自Thermo公司)进行蛋白互作检测,操作分为三步:
(1)混匀Immobilized Glutathione,彻底重悬树脂。
(2)各取 100 µL 50%树脂悬浮液到4个离心管中,1250 ×g 离心2 min弃上清。
(3)用 500 µL PBS 重悬树脂,1250 ×g 离心2 min移除上清,重复3次。
(1)按照表1分别将A-GST蛋白和B-His蛋白加入到谷胱甘肽树脂中,将混合物在 4℃旋转混匀孵育过夜。
(2)1250 ×g 离心5 min 后,弃上清(上清要取净)。
(3)用 500 µL PBS 重悬树脂,1250 ×g 离心2 min弃上清,重复3次。
(1)每管加入 50 µL Elution Buffer。
(2)4℃旋转混匀孵育20 min。
(3)1250 ×g 离心2 min弃上清,离心下来的液体置于冰上。
(4)取 20 µL 样品进行SDS-PAGE和WB检测。
| 阶段 | 关键操作 | 关键参数 |
|---|---|---|
| 转化与接种 | 载体转化Rosetta;单克隆接种含Amp的LB | 50 μg/mL Amp;37℃摇菌过夜 |
| 诱导表达 | 1:100接种;OD₆₀₀=0.8时加入IPTG | IPTG终浓度 0.5 mM;11–28℃;4–8 h |
| 细胞破碎 | 离心弃上清;PBS重悬;超声破碎 | 离心取上清用于后续纯化 |
| GST柱纯化 | 上样 → 冲洗 → 洗脱 → 透析 | 冲洗至 OD₂₈₀ 到达基线;Tris-HCl 透析过夜 |
| Ni柱纯化 | 上样 → 冲洗 → Washing → 洗脱 → 透析 | 冲洗至 OD₂₈₀ 到达基线;Tris-HCl 透析过夜 |
| 平衡树脂 | 100 µL 50%树脂悬浮液;PBS洗涤3次 | 1250 ×g 离心2 min |
| 蛋白互作 | 按表1加样;4℃旋转混匀孵育 | 孵育过夜;PBS洗涤3次 |
| 洗脱 | 加Elution Buffer;4℃旋转孵育20 min | 50 µL Elution Buffer;取20 µL 检测 |
| 检测 | SDS-PAGE 和 Western Blot | 对照四组同时检测 |
Q1:GST pull-down的原理是什么?
GST Pull-Down实验基于GST(glutathione-S-transferase,谷胱甘肽-S-转移酶)可以与谷胱甘肽(GSH)结合。将GSH固定于琼脂糖珠上形成GSH-琼脂糖珠,将已知蛋白X与GST融合表达,获得的GST-X可与GSH-琼脂糖珠结合,若环境中存在与X蛋白互作的蛋白Y,则会形成"琼脂糖珠-GSH-GST-X-Y"复合物,与X蛋白互作的蛋白即可被分离并检测。
Q2:GST pull-down实验为什么要设置对照组?
实验设计通常设置4组:1组(A-GST + B-His)、2组(B-His单独)、3组(GST单独 + B-His)、4组(A-GST + B-His重复)。通过多组对照,可区分诱饵蛋白A与目标蛋白B的特异性互作、GST标签本身的非特异吸附,以及His标签的非特异结合,确保结果可信。
Q3:GST融合蛋白诱导表达的关键条件是什么?
关键条件:1)表达载体转化至大肠杆菌Rosetta感受态;2)菌体OD₆₀₀达到0.8时加入IPTG;3)IPTG终浓度为0.5 mM;4)11–28℃低温诱导4–8 h;5)PBS重悬后超声破碎,离心取上清;6)SDS-PAGE检测表达情况。
Q4:GST柱纯化和Ni柱纯化有什么区别?
GST柱亲和纯化利用GST与谷胱甘肽(GSH)的特异性结合,用于纯化GST融合蛋白,洗脱用GST Elution-Buffer(含还原型谷胱甘肽);Ni柱纯化利用His标签与Ni-IDA的螯合作用,用于纯化His融合蛋白,洗脱用Ni-IDA Elution-Buffer(含咪唑)。两者分别对应诱饵蛋白和靶蛋白的纯化需求。
Q5:GST pull-down实验中为什么要孵育过夜?
GST pull-down实验中,蛋白互作采用4℃旋转混匀孵育过夜的方式。低温(4℃)可降低蛋白酶活性、减少蛋白降解,同时促进特异性互作形成;缓慢旋转混匀保证树脂与样品充分接触;过夜孵育则保证结合达到平衡,提高弱互作的检测灵敏度。
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