GST pull-down 技术原理及实验流程

  ◎当前位置:首页>>科研服务>>生物大分子互作研究>>GST pull-down互作检测>>GST pull-down技术原理及实验流程

GST pull-down是体外检测蛋白间直接互作的行之有效的方法,可用于证实预测的蛋白质-蛋白质相互作用的存在,也可用作未知的蛋白质-蛋白质相互作用的初始筛选测定法

本文以钟鼎生物的典型实验案例为线索,系统讲解GST pull-down的技术原理、实验设计、融合蛋白诱导表达、GST/Ni柱纯化及pull-down实验的完整操作流程,并附实验体系表速查表常见问题解答,供实验参考。

本文内容速览:

  1. 一、GST pull-down 的原理
  2. 二、实验设计——四组对照体系
  3. 三、IPTG诱导融合蛋白表达
  4. 四、细胞破碎及蛋白纯化(GST柱 / Ni柱)
  5. 五、GST pull-down实验操作
  6. 六、实验流程速查表
  7. 七、常见问题解答(FAQ)

PART 01一、GST pull-down 的原理

GST pull-down 实验基于 GST(glutathione-S-transferase,谷胱甘肽-S-转移酶),它可以与谷胱甘肽(Glutathione,GSH)特异性结合。

将GSH固定于琼脂糖珠上,形成GSH-琼脂糖珠;将已知蛋白X与GST融合表达,获得的GST-X可与GSH-琼脂糖珠结合。若环境中存在与X蛋白互作的蛋白Y,则会形成"琼脂糖珠-GSH-GST-X-Y"复合物,与X蛋白互作的蛋白即可被分离并检测。

GST pull-down 复合物形成示意
琼脂糖珠 GSH GST 诱饵蛋白 X 互作蛋白 Y

GST标签与GSH特异结合,诱饵蛋白X与互作蛋白Y结合,形成"琼脂糖珠-GSH-GST-X-Y"复合物。离心收集琼脂糖珠,即可将与X互作的蛋白Y一同分离下来,用于SDS-PAGE或Western Blot检测。

PART 02二、实验设计——四组对照体系

本实验基于钟鼎生物实际案例,验证预测的两个蛋白(A与B)之间的互作。为了区分特异性互作非特异吸附,共设置4组对照体系:

表1 GST pull-down 实验体系
组份 1 2 3 4
A-GST + +
B-His + + +
GST +

四组对照的作用:

  • 第1组:A-GST + B-His → 验证A与B是否互作。
  • 第2组:B-His单独 → 检测B-His是否被GSH树脂非特异吸附。
  • 第3组:GST + B-His → 检测GST标签本身是否与B-His非特异结合。
  • 第4组:A-GST + B-His(重复)→ 作为第1组的重复验证,提高结果可靠性。

PART 03三、IPTG诱导融合蛋白表达

将诱饵蛋白A与GST标签融合(pGEX-4T-1-A),将靶蛋白B与His标签融合(pET28a-B-His),分别通过IPTG诱导表达。

表达操作流程

1.1 表达载体转化至大肠杆菌Rosetta感受态。

1.2 挑取转化平板上的单克隆接种于含 50 μg/mL Amp 的3 mL LB培养液的试管中,37℃摇菌过夜,制备种子液。

1.3 次日按 1:100 接种于含50 μg/mL Amp的30 mL LB培养液中,37℃摇至菌体 OD₆₀₀ = 0.8

1.4 向菌液中加入IPTG至终浓度为 0.5 mM11–28℃ 摇床培养,诱导融合蛋白表达 4–8 h

1.5 将菌液离心弃上清,用PBS重悬菌体沉淀,超声波破碎,离心取上清。

1.6 吸取少量上清用于SDS-PAGE检测目的蛋白表达情况。

关键参数汇总:菌体 OD₆₀₀ = 0.8 → IPTG终浓度 0.5 mM → 诱导温度 11–28℃ → 诱导时间 4–8 h。低温诱导是保证融合蛋白可溶性的关键。

PART 04四、细胞破碎及蛋白纯化

采用超声破碎,分别使用GST柱亲和纯化Ni柱亲和纯化,获得纯化后的目的蛋白。

4.1 GST柱纯化(用于A-GST融合蛋白)

(1)利用低压层析系统,细胞裂解上清液上样至GST Binding-Buffer预平衡的GST亲和层析柱

(2)用GST Binding-Buffer冲洗层析柱,至流出液 OD₂₈₀值到达基线

(3)用GST Elution-Buffer洗脱目的蛋白,收集流出液。

(4)收集的蛋白溶液加入透析袋中,使用Tris-HCl透析过夜

(5)进行SDS-PAGE分析和WB分析。

4.2 Ni柱纯化(用于B-His融合蛋白)

(1)利用低压层析系统,细胞裂解上清液上样至Ni-IDA Binding-Buffer预平衡的Ni-IDA-Sepharose Cl-6B亲和层析柱

(2)用Ni-IDA Binding-Buffer冲洗层析柱,至流出液 OD₂₈₀值到达基线

(3)用Ni-IDA Washing-Buffer冲洗层析柱,至流出液OD₂₈₀值到达基线。

(4)用Ni-IDA Elution-Buffer洗脱目的蛋白,收集流出液。

(5)收集的蛋白溶液加入透析袋中,使用Tris-HCl进行透析过夜。

(6)进行SDS-PAGE分析和WB分析。

两种纯化方式对比:GST柱利用GST-GSH特异性结合纯化A-GST融合蛋白,洗脱时使用含还原型谷胱甘肽的洗脱液;Ni柱利用His标签与Ni²⁺螯合纯化B-His融合蛋白,洗脱时使用含咪唑的洗脱液。两种标签互不干扰,可分别纯化后再进行pull-down互作检测。

PART 05五、GST pull-down 实验操作

使用 GST Protein Interaction Pull-Down Kit(购自Thermo公司)进行蛋白互作检测,操作分为三步:

5.1 平衡树脂(GST)

(1)混匀Immobilized Glutathione,彻底重悬树脂。

(2)各取 100 µL 50%树脂悬浮液到4个离心管中,1250 ×g 离心2 min弃上清。

(3)用 500 µL PBS 重悬树脂,1250 ×g 离心2 min移除上清,重复3次。

5.2 蛋白互作

(1)按照表1分别将A-GST蛋白和B-His蛋白加入到谷胱甘肽树脂中,将混合物在 4℃旋转混匀孵育过夜

(2)1250 ×g 离心5 min 后,弃上清(上清要取净)。

(3)用 500 µL PBS 重悬树脂,1250 ×g 离心2 min弃上清,重复3次。

5.3 诱饵蛋白和靶蛋白复合物的洗脱

(1)每管加入 50 µL Elution Buffer

(2)4℃旋转混匀孵育20 min

(3)1250 ×g 离心2 min弃上清,离心下来的液体置于冰上

(4)取 20 µL 样品进行SDS-PAGE和WB检测。

速查六、实验流程速查表

GST pull-down 全流程关键参数速查
阶段 关键操作 关键参数
转化与接种 载体转化Rosetta;单克隆接种含Amp的LB 50 μg/mL Amp;37℃摇菌过夜
诱导表达 1:100接种;OD₆₀₀=0.8时加入IPTG IPTG终浓度 0.5 mM;11–28℃;4–8 h
细胞破碎 离心弃上清;PBS重悬;超声破碎 离心取上清用于后续纯化
GST柱纯化 上样 → 冲洗 → 洗脱 → 透析 冲洗至 OD₂₈₀ 到达基线;Tris-HCl 透析过夜
Ni柱纯化 上样 → 冲洗 → Washing → 洗脱 → 透析 冲洗至 OD₂₈₀ 到达基线;Tris-HCl 透析过夜
平衡树脂 100 µL 50%树脂悬浮液;PBS洗涤3次 1250 ×g 离心2 min
蛋白互作 按表1加样;4℃旋转混匀孵育 孵育过夜;PBS洗涤3次
洗脱 加Elution Buffer;4℃旋转孵育20 min 50 µL Elution Buffer;取20 µL 检测
检测 SDS-PAGE 和 Western Blot 对照四组同时检测

FAQ七、常见问题解答

Q1:GST pull-down的原理是什么?

GST Pull-Down实验基于GST(glutathione-S-transferase,谷胱甘肽-S-转移酶)可以与谷胱甘肽(GSH)结合。将GSH固定于琼脂糖珠上形成GSH-琼脂糖珠,将已知蛋白X与GST融合表达,获得的GST-X可与GSH-琼脂糖珠结合,若环境中存在与X蛋白互作的蛋白Y,则会形成"琼脂糖珠-GSH-GST-X-Y"复合物,与X蛋白互作的蛋白即可被分离并检测。

Q2:GST pull-down实验为什么要设置对照组?

实验设计通常设置4组:1组(A-GST + B-His)、2组(B-His单独)、3组(GST单独 + B-His)、4组(A-GST + B-His重复)。通过多组对照,可区分诱饵蛋白A与目标蛋白B的特异性互作、GST标签本身的非特异吸附,以及His标签的非特异结合,确保结果可信。

Q3:GST融合蛋白诱导表达的关键条件是什么?

关键条件:1)表达载体转化至大肠杆菌Rosetta感受态;2)菌体OD₆₀₀达到0.8时加入IPTG;3)IPTG终浓度为0.5 mM;4)11–28℃低温诱导4–8 h;5)PBS重悬后超声破碎,离心取上清;6)SDS-PAGE检测表达情况。

Q4:GST柱纯化和Ni柱纯化有什么区别?

GST柱亲和纯化利用GST与谷胱甘肽(GSH)的特异性结合,用于纯化GST融合蛋白,洗脱用GST Elution-Buffer(含还原型谷胱甘肽);Ni柱纯化利用His标签与Ni-IDA的螯合作用,用于纯化His融合蛋白,洗脱用Ni-IDA Elution-Buffer(含咪唑)。两者分别对应诱饵蛋白和靶蛋白的纯化需求。

Q5:GST pull-down实验中为什么要孵育过夜?

GST pull-down实验中,蛋白互作采用4℃旋转混匀孵育过夜的方式。低温(4℃)可降低蛋白酶活性、减少蛋白降解,同时促进特异性互作形成;缓慢旋转混匀保证树脂与样品充分接触;过夜孵育则保证结合达到平衡,提高弱互作的检测灵敏度。

猜您想看:




相关服务

进口试剂盒 GST pulldown
弱互作 光交联AP-ms
定量判断结合亲和力 MST微量热泳动
建库筛库 酵母双杂交