酵母双杂交

1、酵母单杂Y1H和Y187系统有什么区别?

Y1H是Bait整合在基因组上的,Bait质粒(pAbAi)需要先线性化。筛选标记为-Ura,报告基因为AbAr

Y187系统是在Bait质粒上与Prey互作验证的,Bait质粒(pHis)不需要线性化。筛选标记为-Trp,报告基因为His3


2、酵母双杂交AH109和Y2H系统有什么区别?

系统AH109Y2H
杂交方法共转化杂交
报告基因His3、Ade2、LacZHis3、Ade2、AbAr、Mel1
优点筛选后的重复数目比较少验证成本低。文库菌可以使用百次以上杂交效率更高报告基因筛选体系更严格,大大减少假阳性。
缺点杂交效率偏低使用文库质粒,能用的次数少。建库终产物没有质粒,验证成本高。
推荐使用一对一验证库筛

3、酵母营养缺陷型中的二缺、四缺都是什么?

营养缺陷型标记对应条件
-TrppGBKT7质粒、pHis质粒
-LeupGADT7质粒
-His双杂Y2H报告基因、单杂Y187报告基因
-Ade双杂Y2H报告基因
-UrapAbAi质粒

酵母核体系双杂交-Y2HGold体系 单缺(SD-Trp、SD-Leu)用于单转化的营养缺陷型筛选标记,只用于筛选单转化成功的质粒,不能确定目的基因表达与否。
双缺(DDO)用于筛选含BD和AD的杂交菌株,只能确认知否同时含BD和AD质粒,不能确定是否互作。
四缺(QDO)初步判定是bait和prey是否存在互作。
QDO/AHis3营养缺陷筛选后,会有大量假阳性,加入独立的Gal4启动子调控的AbAr,筛选条件会进一步严格。
如果杂交后直接在QDO/A上筛选,会由于突然过于严格的筛选条件导致互作较弱的酵母不会生长。
酵母核体系双杂交-AH109体系 单缺、双缺、四缺同上单缺、双缺、四缺同上
单杂交Y187系统 单缺(SD-Trp、SD-Leu)用于单转化的营养缺陷型筛选标记,只用于筛选单转化成功的质粒,不能确定目的基因表达与否。
双缺(DDO)用于筛选含pHis和pGADT7的菌株
三缺(TDO)+3-AT报告基因His3检测互作情况。3-AT见Q4

4、3-AT的作用时什么?

①3-AT是组氨酸的竞争性抑制剂,可以抑制His3的泄露表达和轻微自激活现象。

②一般Y2H双杂体系中不存在泄露表达,使用3-AT情况较少,AH109同理。常规自激活检测不会进行3-AT浓度抑制检测,存在自激活情况时才会进行3-AT浓度抑制检测。

③单杂Y187体系,一般都会有泄露表达和自激活情况,需要0~100mM的3-AT梯度检测。没有特殊说明按常规梯度浓度设置。

④单杂Y1H体系,报告基因不是组氨酸营养缺陷型,无需做3-AT自激活检测。但是报告基因AbA需要设置梯度浓度自激活检测。


5、单双杂系统较多,如何选择?

①您如果没有特殊要求:

系统体系选择
双杂一对一验证AH109体系
双杂库筛Y2H体系
单杂一对一和库筛Y187

②如果您对双杂交的杂交方法或共转化方法有特殊要求或偏好,或对单杂启动子位于质粒或基因组有明确要求,或其他特殊要求,我们也可以提供定制服务。钟鼎生物有多项关于新型酵母双杂技术的合作开发,有多种高通量“库筛库”技术体系,经验丰富,欢迎您的咨询。


6、贵公司能否进行表达鉴定?

可以对Gal4 DNA-BD和Gal4 AD进行WB检测。


7、我对实验设计和图片有特殊要求,公司可否满足?

①如果您对实验设计有要求,需提前向我们说明,我们会根据实际情况给您答复。

②图片我们会尽量满足您的要求。但受限于拍摄器材,如果仍无法满足您的要求,我们可以寄送材料给您自行拍摄。