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SUMO蛋白是一种与泛素在高级结构上高度相似的小型相关修饰物,其独特之处在于拥有一段飘逸的N端延伸结构。SUMO化修饰(sumoylation)作为一种重要的小蛋白类型蛋白质翻译后修饰,身兼多职。

1、保护蛋白质免受泛素化降解,这是由于sumo化修饰和泛素化修饰都是发生在赖氨酸的残基上,当某一种修饰占位过后,另一种发生在同样位点的修饰将会被竞争性的削弱。
2、改变蛋白质的胞内分布,sumo化可以调节蛋白在细胞核和细胞质之间的转运。
3、调控转录因子的活性,比如p53蛋白质的sumo化就可以抑制其转录活性,导致调控细胞的周期和细胞的凋亡。
4、调节蛋白和蛋白之间的相互作用,sumo话可以改变蛋白的表面构象和特征,从而影响它与其他蛋白的结合能力。
5、参与DNA的损伤修复。

SUMO与泛素的结构对比

一、SUMO化原理

SUMO化是指SUMO蛋白共价结合到目的蛋白质上的赖氨酸残基上,导致目的蛋白分子被修饰的过程。在发生修饰前,前体SUMO分子被SUMO特异性蛋白酶加工切割,使其C末端暴露出2个甘氨酸残基(GG),形成可用于修饰的成熟形式的SUMO-GG。单个SUMO-GG被激活酶识别并激活后,在酶和连接酶的有序协作中被精准地通过异肽键共价修饰于底物蛋白的赖氨酸残基上,从而完成整个修饰过程。

sumo化流程


二、体外SUMO化检测流程

体外SUMO化的检测的流程主要分为共转化、诱导、免疫印迹三个步骤:

①共转化: SUMO关键组分载体导入大肠杆菌, 通过卡那霉素和氯霉素平板筛选阳性克隆; 制备感受态细胞: 将获得的阳性克隆制备成感受态细胞; 共转化: 将构建好的底物蛋白表达载体(带有独立的E3表达框)导入感受态细胞, 通过卡那霉素、氯霉素和链霉素平板筛选阳性克隆;
②诱导: 通过IPTG诱导蛋白表达;
③免疫印迹: 通过SDS-PAGE凝胶电泳将不同分子量的蛋白分离, 将蛋白从凝胶转移至PVDF膜上, 将封闭后的PVDF 膜与抗体进行孵育, 通过显影观察并记录实验结果。

sumo化检测流程



三、文献解读

1.Targeting pancreatic cancer by TAK-981: a SUMOylation inhibitor that activates the immune system and blocks cancer cell cycle progression in a preclinical model(IF=23.06)

sumo化文献解读

图1:SUMO通路成分在PDAC中过表达,是肿瘤细胞增殖所必需的。


研究者假设SUMO化在胰腺癌的发生和发展中可能扮演重要角色,并希望通过抑制SUMO化来探索新的胰腺癌治疗策略。

首先,为了评估SUMO化在胰腺癌的潜在作用,研究者收集了胰腺癌组织样本和相邻正常组织样本,通过免疫组化等方法检测SUMO化相关蛋白的表达水平,以明确SUMO化在胰腺癌中的表达模式。结果显示,与相邻正常组织相比,胰腺癌组织中SUMO1、SUMO2/3等SUMO化相关蛋白的表达水平显著升高,且高表达水平与患者的不良预后相关。

其次,作者利用胰腺癌细胞系(如MiaPaCa2、PANC1等)进行体外实验,通过添加SUMO E1抑制剂TAK-981来观察其对癌细胞增殖、细胞周期、凋亡以及免疫反应的影响。发现TAK-981处理后的胰腺癌细胞增殖受到明显抑制,细胞周期阻滞在G2/M期,且出现微核等染色体分离缺陷的标志。此外,TAK-981还能激活免疫细胞,诱导干扰素靶基因的表达。

接着,通过动物实验发现在胰腺癌小鼠模型中,TAK-981治疗显著抑制了肿瘤生长,并促进了免疫细胞的肿瘤浸润。同时,TAK-981还能增加外周血中特定免疫细胞的比例,进一步证实了其免疫调节作用。

研究者认为,SUMO化在胰腺癌中发挥着重要作用,而SUMO E1抑制剂TAK-981具有潜在的抗肿瘤效果,其机制可能涉及抑制癌细胞增殖和激活免疫反应两个方面。



2.Epac1 activation by cAMP regulates cellular SUMOylation and promotes the formation of biomolecular condensates(IF=14.14)

sumo化文献解读

图2.Epac1与SUMO化机制相关联并促进细胞内的SUMO化。


Epac1作为一种G蛋白偶联受体(GPCR)的效应器,已被发现与多种细胞功能有关,但其是否以及如何调控SUMO化过程尚未明确。作者提出假设:Epac1可能通过某种机制调控细胞内的SUMO化过程。

首先,研究者们探究了Epac1激活对细胞内SUMO化水平的影响。他们发现,当Epac1被激活时,会促进细胞内SUMO E1和E2酶的活性。为了验证这一点,他们监测了在非还原条件下,没有2-巯基乙醇的SDS样本缓冲液中UBA2-SUMO硫酯中间体(UBA2)或UBC9-SUMO硫酯中间体(UBC9)的水平。结果显示,用007-AM激活Epac1后,内源性UBA2和UBC9的水平增加,这表明Epac1的激活确实提升了SUMO E1和E2酶的活性,从而提高了细胞内的SUMO化水平。

然后,研究者们进一步探究了Epac1是否直接激活SUMO E1和E2。他们通过体外实验,表达了SUMO化机器的各个重组成分,包括AOS1/UBA2、UBC9和SUMOs,并进行了体外SUMO E1/E2硫酯形成实验。结果发现,无论是在有还是无cAMP的情况下,Epac1都不能增强UBC9硫酯的形成,这表明Epac1并不直接在体外激活SUMO E1/E2。

接着,研究者们又发现,Epac1的激活会促进Epac1核凝聚物的形成,这些凝聚物与核内的UBA2/UBC9/SUMO2/3凝聚物共定位。这一发现表明,Epac1可能通过一种非传统的方式来促进细胞内的SUMO化,即通过促进相关蛋白的凝聚来增强SUMO化的发生。为了验证这一点,他们进行了一系列的免疫荧光实验和免疫印迹分析,结果支持了他们的假设。

最后,研究者们总结了他们的发现,提出Epac1凝聚物作为“SUMO化组织者”来普遍增强SUMO化,这一机制为理解Epac1在细胞内的功能和SUMO化在生物学过程中的作用提供了新的视角。他们的研究不仅揭示了Epac1激活与细胞内SUMO化水平变化之间的直接联系,还为我们理解细胞内的蛋白修饰和信号传导提供了新的思路。



四、案例分享


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SUMO E1 - - +
SUMO E2 - - +
SUMO GG - + +
底物蛋白 + - +
SUMO反应缓冲液 - - +

使用底物蛋白抗体进行WB检测:

sumo化文献解读

分不同时间段取样,使用底物蛋白抗体进行WB检测:

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SUMO反应缓冲液 + + + + + + + + +
SUMO E1 - - - + + + + + +
SUMO E2 - - + - + + + + +
SUMO GG - + + + + + + + +
底物蛋白 + - + + + + + + +

sumo案例



五、相关链接

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