离子交换层析法是根据电荷特性分离生物分子的一种蛋白纯化方法,由于该法操作简易,分辨率高且通量大,迅速成为蛋白质、多肽、核酸及大部分发酵产物分离纯化的一种重要方法。本文介绍了离子交换层析的原理,介质以及常见问题解析。
1.离子交换层析的基本原理:
离子交换层析法是蛋白纯化的一种方式,通过带电的溶质分子与离子交换层析介质中可交换离子进行交换,从而达到分离纯化的目的。
离子交换层析法主要依据电荷间的相互作用,利用带电分子中电荷的微小差异而进行分离,具有较高的分离容量。几乎所有的生物大分子都是极性的,都可使其带电,所以离子交换层析法的应用很广泛。
2.离子交换层析的介质:
有许多离子交换介质都已经商品化,但不存在一种神奇的介质其最适合各种蛋白质的纯化。选择离子交换介质的标准包括应用的特异性需要、样品成分的等电点和分子大小(即目的蛋白和污染物),以及可得到的装备(如泵和柱子)。
首先需要选择阴离子或阳离子介质,如果目的蛋白的等电点已知,选择阴离子介质且操作的pH高于目的蛋白的pI,或选择阳离子介质且操作pH低于目的蛋白的pI。如果靶蛋白的pI未知,开始之前最好先测定它。最佳操作pH可根据经验确定。因为大多数蛋白质的pI低于7,选择阴离子交换和操作pH为8.5开始是合理的,然后根据估计结果和优化条件。知道蛋白质溶液中污染物pI和结合特征也是有用的。
3.离子交换层析的缓冲系统:
必须根据需要的pH范围选择缓冲系统,必须考虑的因素包括所用的离子交换类型、样品的pH稳定性和使用的pH范围,以及需要的缓冲能力,最后是成本。下表列出了各种有用的缓冲液。缓冲液中的添加成分(如变性剂和蛋白酶抑制剂)也应和离子交换介质带有相同的电荷,以组织结合。
pK(25℃) | pH范围 | 缓冲液 | 工作浓度/(mmol/L) | 温度因子 |
---|---|---|---|---|
阴离子交换 | ||||
4.75 | 4.5~5.0 | N-Methylpiperazine | 20 | -0.015 |
5.68 | 5.0~6.0 | Piperazine | 20 | -0.015 |
5.96 | 5.5~6.0 | L-Histidine | 20 | |
6.46 | 5.8~6.4 | Bis-Tris | 20 | -0.017 |
6.80 | 6.4~7.3 | Bis-Tris propane | 20 | |
7.76 | 7.3~7.7 | Triethanolamine | 20 | -0.02 |
8.06 | 7.6~8.5 | Tris•Cl | 20 | -0.028 |
8.52 | 8.0~8.5 | N-Methyladiethanolamine | 50 | -0.028 |
8.88 | 8.4~8.8 | Diethanolamine | 20(pH8.4) | -0.025 |
8.64 | 8.5~9.0 | 1,3-Diaminopropane | 20 | -0.031 |
pK(25℃) | pH范围 | 缓冲液 | 工作浓度/(mmol/L) | 温度因子 |
---|---|---|---|---|
阳离子交换 | ||||
2.00 | 1.5~2.5 | Maleic acid | 20 | |
2.88 | 2.4~3.4 | Malonic acid | 20 | |
3.13 | 2.6~3.6 | Citric acid | 20 | -0.0024 |
3.81 | 3.6~4.3 | Lactic acid | 50 | |
3.75 | 3.8~4.3 | Formic acid | 50 | +0.0002 |
4.21 | 4.3~4.8 | Butanedioic acid | 50 | -0.0018 |
4.76 | 4.8~5.2 | Acetic acid | 50 | +0.0002 |
5.68 | 5.0~6.0 | Malonic acid | 50 | |
7.20 | 6.7~7.6 | Phosphate | 50 | -0.0028 |
7.55 | 7.6~8.2 | HEPES | 50 | -0.0140 |
4.离子交换层析常见问题解析:
问题 | 可能的原因 | 解决方案 |
---|---|---|
在盐梯度中蛋白质不能洗脱 | 缓冲液的pH不对 盐浓度太低 |
使用pH更靠近蛋白质pI的缓冲液 使用更浓的洗脱缓冲液 |
蛋白质出现在清洗相中 | 结合缓冲液的盐浓度太高 样品的盐浓度太高或pH错误 柱子没平衡好 离子变性剂或其他添加剂 结合到柱子上 |
降低结合缓冲液的盐浓度 更换样品的缓冲液 重复或延长平衡时间直到电导恒定 清洗柱子 |
分辨率比预想的要低 | 梯度斜率太抖 流速太高 蛋白质或脂质沉淀到柱子上 样品上样前没有恰当过滤 蛋白形成聚合体 凝胶紧密结合 柱子安装不好 检测仪的流动池或柱中或柱后的混合体积太大 |
使用更平缓的梯度或增加一个平台 较低的流速下分离 清洗和再生柱子 再生柱子、过滤样品、重复层析 使用脲素或变性剂清洗柱子 运行有色的化合物观察条带检测装柱效果,如有必要重装柱子 更换流动池或减小柱后体积 |
层析图中峰形前拖尾或太圆 | 柱子超载 柱子没装好 柱子需要再生 |
降低样品的上样量,重复试验 运行有色的化合物观察条带检测装柱效果,如有必要重装柱子 清洗再生柱子,如果这样还不行,换一个新的 |
层析图汇总峰形拖尾 | 样品太黏 柱子的滤器上或凝胶床的顶部 发生了蛋白沉淀 柱子装的不好 |
减低蛋白质的量,从样品中出去核酸 清洗柱子,更换或清洗滤器 |
获得的蛋白质量正常但活性低 | 靶蛋白在洗脱缓冲液中不稳定,因而失活了 酶与辅酶或对其活性是必需的因子分离 柱子上有微生物生长 |
变换洗脱条件 收集所有的组分进行测定并重复试验 清洗柱子并且在20%乙醇中或其他抑菌剂中保存凝胶 |
洗脱级分中蛋白质的量比预想的少得多 | 蛋白质被蛋白酶降解 在样品的准备中蛋白质吸附到过滤器上 柱子上有微生物生长 |
在缓冲液中加蛋白酶抑制剂 使用其他型号的滤器并在缓冲液中加变性剂 清洗柱子并且在20%乙醇中或其他抑菌剂中保存凝胶 |
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