影响植物组织蛋白质纯化的因素
植物在蛋白质纯化方面存在一些特殊的问题,使得单位体积蛋白得率比动物或原核生物要低,而且组织的破坏、干扰纯化和具有氧化作用的天然物质的存在会影响酶的活性。谨慎选择材料来源以及恰当的组织破碎方法就显得很重要。一旦蛋白质成为可分离的形式,植物蛋白就可像其他蛋白一样,采用一般的纯化方法进行处理。
蛋白质浓度低
与大部分其他生物不同,植物的大量固体物质并不是蛋白质,而是包括淀粉、纤维素、果胶和半纤维素以及多酚等在内的其他大分子物质。最初的均质化必须在大量的缓冲液中进行,以便初步过滤。大量的不溶性物质由于凝胶作用或者简单的吸附作用会影响过滤,因此最初只能得到低浓度的蛋白质,需要经过沉淀或浓缩。均质化后硫酸铵沉淀、PEG沉淀对于植物蛋白质很常用。如果采用超滤浓缩,应考虑植物蛋白与膜结合的能力,以免产生负面影响。
蛋白质水解
植物蛋白质纯化有时会出现蛋白质水解的问题,常伴有初始蛋白质浓度的降低,这可能由于初始步骤操作时间过长,或者存在蛋白酶的作用。植物含有的主要蛋白水解酶类包括丝氨酸蛋白酶、半胱氨酸蛋白酶和金属蛋白酶,可选用相应的抑制剂。1mmol/L的PMSF适用于丝氨酸蛋白酶的抑制(表1)。
抑制和褐变
许多植物组织富含氧化酶,它们作用于内源底物,产生活性产物,与酶反应后使其钝化,这可能是植物天然防御机制的一部分。多酚氧化酶存在于许多植物中,如马铃薯、苹果、香蕉和甜菜,从而产生褐变反应,特别是当游离酪氨酸存在时。其他植物如豆类,组织破碎时所大量释放的过氧化物酶也会引起褐变反应。通过除去底物或抑制氧化酶可以减少褐变反应。阳离子树脂 (如Dowe ×1 ×2)或疏水作用树脂 (如Am berlite XAD-2)可用于去除反应底物。反应抑制剂可以使用硫醇、2-巯基乙醇或二硫苏糖醇,也可选择抗坏血酸 (但应注意对均质缓冲液pH的影响)或偏亚硫酸氢钠 (表1)。
表1 植物组织提取缓冲液常用的保护剂 | |||
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保护剂 | 最终浓度 | 保护剂 | 最终浓度 |
渗压剂 蔗糖 山梨醇 甘油 |
0.33-0.5mol/L 0.33mol/L 10%(体积分数) |
Dowe ×1 ×2树脂 偏亚硫酸氢钠 |
1%-5%(10-50g/L) 1-5mmol/L |
抗氧化剂 2-巯基乙醇 二硫苏糖醇 抗坏血酸(维生素C) |
1-10mmol/L 1-10mmol/L 1-20mmol/L |
蛋白酶抑制剂 牛血清白蛋白 PMSF 对氯汞苯甲酸 EDTA 亮肽素 抑胃肽 抑凝乳蛋白酶素 |
1%-5%(10-50g/L) 1mmol/L 1mmol/L 1mmol/L 1mmol/L 10-100umol/L 1umol/L 10-100umol/L |
酚氧化抑制剂 PVP 苯酚甲醛离子交换树脂XDA-2 |
1%-5%(10-50g/L) 1%-5%(10-50g/L) |
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