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随着ABPPSM pull down等小分子靶点发现技术的发展,越来越多的药物靶标被发现。那么利用靶标反向去筛选更多的小分子活性化合物也变得关键起来,接下来我们介绍一下今天的主角--基于SPR的分子垂钓技术。

SPR垂钓策略

SPR分子垂钓的策略说起来也简单,就像我们钓鱼一样,把你的A蛋白作为“鱼饵” 固定在芯片上,去钓取细胞粗提液中与“鱼饵”结合的未知分子,然后再通过质谱鉴定钓得的未知分子就可以了。此种策略在方法学上具有样品消耗量小、无需对样品化学标记、能实时监测生物分子间的相互作用等优势。

技术流程

相关文献

1. A strategy of screening and binding analysis of bioactive components from traditional Chinese medicine based on surface plasmon resonance biosensor.

作者基于SPR的垂钓策略,将TNF-R1蛋白固定在芯片表面,钓取了芍药苷和丹皮酚两种小分子活性化合物,后续通过SPR检测亲和力常数证实了他们存在直接相互作用,并通过分子对接探究了具体的结合位点。

SPR案例图

图1:从白芍(RPA)中提取并鉴定与 TNF-R1 结合的成分

SPR案例图

图2:SPR亲和力测定化合物亲和力与分子对接

2. High-affinity SOAT1 ligands remodeled cholesterol metabolism program to inhibit tumor growth.

SOAT1是已知治疗肝癌的靶点蛋白,研究人员想要借此筛选一种能够精准治疗肝癌的有效靶向药物。他们前期用分子对接初步筛选了了62个候选化合物。然后用SPR垂钓实验进一步筛选了3个与SOAT1结合最优的化合物,进而展示了它们在肝癌精准治疗中的临床潜力。

SPR案例图

五、SPR检测相关服务

非标记法 DARTS
定量判断结合亲和力 MST微量热泳动
Octet RED384系统 BLI分子互作
基因表型互作 分子互作技术专题
检测制备标记 抗体服务专题

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