实验原理:利用真核生物mRNA的3'端有poly的特征,可以通过与polyA互补的oligo dT 作为引物,在反转录酶的作用,合成cDNA。
实验目的:检测基因的表达模式,以及确定基因的转录方式,扩增基因cDNA,构建cDNA文库及酵母双(单)杂交文库。
试剂与仪器
DEPC (diethyl pyrocarbonate,sigma,CAS:1609-47-8)
ddH20 (DEPC treated and steriled)
DNase I (Amplification Grade, Invitrogen, CAS:18068-015)
oligo d(T)15 (Promega CAS:C1101)
SS Il1 DOUBLE STRANDED CDNA SYTH KIT (Invitrogen, 1015969)
水浴锅、离心机、PCR 仪等。
0.6mL 及 1.5mL tubes ( AXYGEN)
20ul.200ul k 1mL tips(AXYGEN)
操作步骤:
1.取5 μg总RNA至新的不含RNase的0.5或者1.5 ml离心管中,加入1μl DNase I, 1μl 10x缓冲液,加DEPC处理过的水至总体积10μl,混匀后短暂离心,25°C (室温)孵育15分钟。
2.加入1μl 0.5M EDTA,混匀后短暂离心, 65°C水浴10分钟灭活DNase l。
3.加入1μl oligo d(T)15, dNTP 1μl, 65°C水浴10分钟,然后立即置冰上3分钟,短暂离心。
4.加入5X First strand buffer 4μl, DTT 1μl,反转录酶SSII 1μl, RRI 1μl混匀后短暂离心,于50°C水浴反应2小时。
5.75°C水浴灭活15分钟。
6.按每μg起始RNA量终体积20-30μl加水稀释反转录得到的cDNA。
7.检测反转录效果可用ACTIN-M引物做PCR扩增,判断有无基因组污染及浓度。
注意事项:
1.反转录前应确定RNA浓度及质量。
2.在使用前应注意酶单位及反应条件,此实验所用酶可用其它公司产品代替,但单位及反应条件可能不同。
3.步骤3防止复性,RNA易产生高级结构,影响反转录效果。
4.反转录产物为单链cDNA,稳定性不好,-20°C 保存,减少反复冻融次数。
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