细胞株指纹图谱构建
1985 年,英国来斯特大学的Jeffreys等人报道了DNA指纹图谱的突破性研究。第一次将分离的人源小卫星DNA用作基因探针,同人体核DNA的酶切片段进行Southern杂交,获得了由多个位点上的等位基因组成的长度不等的杂交带图纹,这种图纹极少有两个人完全相同,故称为"DNA指纹"。由于DNA指纹图谱具有多位点性、高变异性、简单而稳定的遗传性,诞生之初就吸引了科学界的聚焦,表现出巨大的实用价值。
利用Southern杂交技术构建细胞株指纹图谱优势
1.准确度高,利用500bp左右的探针,检测到的结果准确性更高,特异性更强;
2.探针33.15通用性强,该探针可应用于各种哺乳细胞株的鉴定和指纹图谱的构建,应用广泛;
3.结果更直观,通过最后的杂交条带,细胞株的鉴定结果一目了然;
4.认可度高,利用该方法鉴定细胞株是得到相关监管机构认可的。
技术路线
样品要求:需要来源相同的细胞株作为阳性对照,来源不同的细胞作为阴性对照
探针设计
多基因座探针(MLP)33.15衍生自人类基因组中的特定高变小环卫星区域,并且将与分布在多种物种的基因组中的重复DNA序列杂交,例如, 人类,仓鼠(CHO,BHK),猿猴。 MLP33.15的个体特异性和多物种杂交使其成为细胞库质量控制的有力工具,能够检测种间和种内细胞污染。
使用一个含有多拷贝数核心序列的多基因座DNA探针(如33.6探针或33.15探针),在低强度条件下(较低温度、较高盐浓度)同时与许多VNTR基因座(约1000个)杂交,经电泳显示其中50-100个基因座的杂交结果,获得由一系列DNA片段谱带组成的图像。
不同探针比较
探针 | DNA片段大小 | 个体平均片段数 | A的片段在B中出现的概率 | 在同一个体中测得所有片段同时在另一无关个体中存在概率 |
---|---|---|---|---|
MYO | 2.3-24 | 14 | 0.21 | 4×10-9 |
α-珠蛋白-3'HVR | 3.0-24 | 12 | 0.24 | 8.1×10-10 |
JL-02 | 4.0-24 | 17 | / | 6.6×10-15 |
33.15(欧洲) | 4.0-24 | 15 | 0.18 | 3×10-11 |
33.6(欧洲) | 4.0-24 | 11 | 0.19 | / |
33.15(中国) | 4.0-24 | 20 | 0.176 | 1.03×10-15 |
33.6(中国) | 4.0-24 | 16 | 0.187 | 1.53×10-11 |
DNA指纹图谱应用
1、DNA指纹识别能够检测种间和种内细胞污染,是细胞库质量控制的有力工具。
2、在人类医学中被用于个体鉴别、确定亲缘关系、医学诊断及寻找与疾病连锁的遗传标记;在动物进化学中可用于探明动物种群的起源及进化过程;在物种分类中,DNA指纹识别是一种强大的用于细胞系鉴定的技术,其他测定可能仅提供功能性可以确认物种的水平信息。在作物的基因定位及育种上也有非常广泛的应用。
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