1、BLI实验中固化方法有哪些?各有什么优劣势?
直接固化 | 抓取固化 |
优势: ● 非常稳定的固化 ● 所有蛋白都可以进行固化 |
优势: ● 不会产生共价键,易于保持蛋白活性 ● 可以固化在粗样品的蛋白 ● 固化的有序性 ● 将固化蛋白与分析蛋白-并再生,回传到传感器原始状态 |
劣势: ● 需要纯化的蛋白 ● 无序的固化 ● 产生共价键,可能对蛋白活性有影响 ● 再生时需要考察固化蛋白的耐受性 |
劣势: ● 固化的密度少于前者 ● 固化稳定性弱于前者 |
2、BLI技术可以提供哪些信息?
1. 分子特异性结合
目标分子间是否存在特异性结合?
2. 结合亲和力(Affnity)
分子结合的紧密程度?KD、KA候选分子排序
3. 结合动力学(Kinetics)
分子互作反应的速度?Ka、Kd
4. 浓度分析
目标分子有多少?
3、BLI技术相对ELISA方法具有哪些优势?
ForteBio (Octet RED96e ) | ELISA | |
时间 | 1小时 | 4-8小时,抗体标记不计 |
是否需要标记 | 否 | 是 |
自动化程度 | 高 | 低 |
样品是否可以重复使用 | 是 | 否 |
抗原耗量 | 1-5ug | 10ug |
是否有配套分析软件 | 是 | 否 |
抗体是否做梯度 | 否 | 是 |
弱亲和力配对 | 是 | 否 |
是否可以实现粗样品配对 | 是 | 否 |
4、BLI实验需要的样品有哪些要求?
样品的均一性 | 蛋白理化性质 | 缓存液成分 | 亚型/标签类型 |
确保样品充分水溶,样品中没有任何沉淀、颗粒——保持样品处于均一的、不聚集的状态 | 纯度(>90%),蛋白浓度 >0.2mg/ml,浓度越高越好; 明确等电点/分子量信息 |
分析物样品中不能含有不要含有高浓度的高聚物物质如PEG等; 氨基偶联的配体溶液中不能含有tris、NaN3、甘氨酸等成分; APS 传感器(膜蛋白相互作用研究)的固化缓冲液不得含有任何去污剂 |
如果配体或分析物是抗体,请告知抗体亚型及种属; 如果配体或分析物是蛋白,请告知标签类型 |
5.BLI可研究的生物分子范围?
蛋白质、DNA/RNA、 脂类 /脂质体/ 生物膜、多糖、多肽、小分子、全细胞/病毒/微生物
钟鼎目前可以检测的亲和力范围:
① 亲和素-生物素结合: 10-14M;
② 强的抗原-抗体结合:10-8 ~10-10 M;
③ DNA 与蛋白的结合:10-8 ~10-10 M;
④ 较弱的抗原-抗体结合:10-6 ~10-7 M;
⑤ 蛋白与小分子结合:10-3 ~10-6 M。
6、BLI实验中遇到非特异性结合怎么办?
在BLI实验中,通常的非特异性结合有两类。
① 分析物直接与固相介质(传感器)结合;
② 分析物缓冲液中的杂志与固化物结合。
改善或消除非特异性结合的方法有以下几种,可以根据具体情况进行尝试。
(1)继续优化反应缓冲液,第一种是摸索合适的pH条件;提高盐离子浓度;第二种是增加表面活性剂的浓度,非离子型如Tween-20,最高至0.05%。
(2)增加一步封闭,在反应缓冲液中加入BSA ,浓度 1-2%;如果BSA有干扰,可以用其他封闭缓冲液替代,如PEG、脱脂奶粉替代或其他市售封闭缓冲液。
(3)尽可能提高分析物的纯度,去除杂质。
(4)固化物和分析物尝试对换。
(5)当使用SA/SAX/SSA生物传感器时的NSB,可以在生物素化的捕获分子固化到传感器上后,用biocytin 封闭残留的链霉亲和素位点。
(6)当使用血清样品时的NSB,可以在血清样品结合之前使用相同浓度的阴性血清作为基线。
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