•PCR亚克隆
•全基因合成
•定点突变
表达载体通用测序引物
在我们的实验中,载体构建完成后需要对质粒进行验证,验证我们的目的基因是否正确连入载体,我们以目的基因的序列设计引物,可以准确的测得目的基因连入载体的情况,但是如果待测序质粒非常多,针对每个目的基因设计引物并合成引物,成本会非常高,因此,我们可以根据载体上的序列设计通用引物,以便于测序所有连入该载体的基因。
本文根据常用质粒的通用原件序列,汇总了各种类型的质粒的通用测序引物序列
载体类型 | 引物序列(5’到3’) |
---|---|
哺乳表达载体CMV启动子型 (F-primer) | CGCAAATGGGCGGTAGGCGTG |
哺乳表达载体U6启动子型 (F-primer) | GACTATCATATGCTTACCGT |
含荧光素酶报告基因 (F-primer) | AGTCAAGTAACAACCGCGA |
M13 (F-primer) | CAGGAAACAGCTATGAC |
M13 (R-primer) | CAGGAAACAGCTATGAC |
MSCV 哺乳动物细胞逆病毒基因表达载体 (F-primer) | CCCTTGAACCTCCTCGTTCGACC |
pGEX 载体 (F-primer) | GGGCTGGCAAGCCACGTTTGGTG |
含SP6启动子的载体 (F-primer) | ATTTAGGTGACACTATAG |
含T3启动子的载体 (F-primer) | GCAATTAACCCTCACTAAAGG |
含T7启动子的载体 (F-primer) | TAATACGACTCACTATAGGG |
含AOX启动子的载体5’AOX1 (F-primer) | GACTGGTTCCAATTGACAAGC |
含35S 启动子载体 (F-primer) | CTATCCTTCGCAAGACCCTTC |
含果蝇肌动蛋白5C启动子载体 (F-primer) | ACACAAAGCCGCTCCATCAG |
含Alpha-factor信号肽载体 (F-primer) | TACTATTGCCAGCATTGCTGC |
氨苄抗性基因5’端序列 (R-primer) | ATAATACCGCGCCACATAGC |
含AUG1 启动子的毕赤酵母表达载体 (F-primer) | CAATTTACATCTTTATTTATTAACG |
含AUG1 启动子的毕赤酵母表达载体 (R-primer) | GAAGAGAAAAACATTAGTTGGC |
含BGH 转录终止子 (R-primer) | TAGAAGGCACAGTCGAGG |
含兔β-珠蛋白内含子载体 (F-primer) | CTGGTCATCATCCTGCCTTT |
含兔β-珠蛋白内含子载体 | TTTGCCCCCTCCATATAACA |
兔β-珠蛋白内含子多聚A区域引物 (R-primer) | TTTTGGCAGAGGGAAAAAGA |
氯霉素抗性基因的5'端序列 (R-primer) | GCAACTGACTGAAATGCCTC |
CRE重组酶5'端序列 (R-primer) | GCAAACGGACAGAAGCATTT |
含CYC1载体 (R-primer) | GCGTGAATGTAAGCGTGAC |
DsRed1 3'端序列 (F-primer) | AGCTGGACATCACCTCCCACAACG |
DsRed1 5'端序列 (R-primer) | GTACTGGAACTGGGGGGACAG |
含SV40 polyA terminator载体 (R-primer) | GTGGTTTGTCCAAACTCATC |
果蝇热休克启动子 (F-primer) | CTCTGAATACTTTCAACAAGTTAC |
哺乳体系含EF-1a启动子载体 (F-primer) | TCAAGCCTCAGACAGTGGTTC |
EGFP 3'端序列 (F-primer) | CATGGTCCTGCTGGAGTTCGTG |
EGFP 5'端序列 (R-primer) | CGTCGCCGTCCAGCTCGACCAG |
含EXFP质粒 (R-primer) | GTCTTGTAGTTGCCGTCGTC |
含F1 origin质粒 (F-primer) | GTGGACTCTTGTTCCAAACTGG |
含GAL1启动子载体 (F-primer) | AATATACCTCTATACTTTAACGTC |
含GaL 10启动子载体 (F-primer) | GGTGGTAATGCCATGTAATATG |
Gal4 DNA结合域3'端序列 (F-primer) | GAGTAGTAACAAAGGTCAA |
Gal4 DNA激活域3'端序列 (F-primer) | AATACCACTACAATGGAT |
GFP 3'端序列 (F-primer) | GGTCCTTCTTGAGTTTGTAAC |
GFP 5'端序列 (F-primer) | CCATCTAATTCAACAAGAATTGGGACAAC |
含GPD 启动子载体 (F-primer) | CGGTAGGTATTGATTGTAATTCTG |
Gateway cassette 3'端序列 (F-primer) | GCATGATGACCACCGATATG |
Gateway cassette 5'端序列 (R-primer) | AATCTCGCCGGATCCTAACT |
哺乳体系载体H1启动子型 | TCGCTATGTGTTCTGGGAAA |
HA标签 (F-primer) | TACCCATACGACGTCCCAGA |
HA标签 (R-primer) | TCTGGGACGTCGTATGGGTA |
HAT标签 (F-primer) | GAGGAGCACGCTCATGCCCAC |
含hGH终止子载体 (R-primer) | CCAGCTTGGTTCCCAATAGA |
含hrGFP载体 (F-primer) | TCCCCGAGTACCACTTCATC |
含hUBC启动子 (F-primer) | TGAAGCTCCGGTTTTGAACT |
IRES 3'端序列 (F-primer) | TGGCTCTCCTCAAGCGTATT |
IRES 5'端序列 (R-primer) | CCTCACATTGCCAAAAGACG |
L4440 载体5'端多克隆位点序列 (F-primer) | AGCGAGTCAGTGAGCGAG (Caldwell lab) 5' of MCS in L4440 vector, forward primer |
LacI 5'端序列 (R-primer) | GGCATACTCTGCGACATCGT |
LacZ 5'端序列 (R-primer) | GACAGTATCGGCCTCAGGAA |
LexA DNA结合域3'端序列 (F-primer) | CGTCAGCAGAGCTTCACCATTG (Caldwell lab) |
哺乳体系载体CMV启动子型 (F-primer) | AGCTCGTTTAGTGAACCGTCAGATC |
Luc 3'端序列 (F-primer) | AGTCAAGTAACAACCGCGA |
Luc 5'端序列 (R-primer) | CCTTATGCAGTTGCTCTCC |
M13 (-21) (F-primer) | TGTAAAACGACGGCCAGT |
M13 (-40) | GTTTTCCCAGTCACGAC |
M13/pUC (F-primer) | CCCAGTCACGACGTTGTAAAACG |
M13/pUC (R-primer) | AGCGGATAACAATTTCACACAGG |
MBP 3’端序列 (F-primer) | GATGAAGCCCTGAAAGACGCGCAG (Waugh lab) |
mCherry 3’端序列 (F-primer) | CCCCGTAATGCAGAAGAAGA |
mCherry 5’端序列 (R-primer) | TTGGTCACCTTCAGCTTGG |
果蝇金属硫蛋白启动子 (F-primer) | CATCTCAGTGCAACTAAA |
MMLV (F-primer) | ATCAGTTCGCTTCTCGCTTC |
mPGK启动子 (F-primer) | CATTCTGCACGCTTCAAAAG |
MSCV (F-primer) | CCCTTGAACCTCCTCGTTCGACC |
MSCV (R-primer) | CAGCGGGGCTGCTAAAGCGCATGC |
MT1 (F-primer) | GCTGTCCTCTAAGCGTCACC |
mU6启动子 (F-primer) | CAGCACAAAAGGAAACTCACC |
Myc (F-primer) | GCATCAATGCAGAAGCTGATCTCA |
Neo 3'端序列 (F-primer) | CGTTGGCTACCCGTGATATT |
Neo 5'端序列 (R-primer) | GCCCAGTCATAGCCGAATAG |
含NOS启动子载体 (F-primer) | GCGTTCAAAAGTCGCCTAAG |
含Nmt1启动子载体 (F-primer) | GCAATGTGCAGCGAAACTAA |
含OpIE2 启动子载体 | CGCAACGATCTGGTAAACAC |
含p15A origin载体 (F-primer) | TGAAGTCAGCCCCATACGAT |
pAd-CMV载体SalI限制酶位点后序列 | GCTAGAGATCTGGTACCGTC |
pBABE载体多克隆位点3'端的SV40 enhancer引物 (R-primer) | ACCCTAACTGACACACATTCC (Weinberg Lab) SV40 enhancer, 3' of MCS in pBABE vectors, reverse primer |
pBABE载体多克隆位点5'端Psi packaging signal引物 | CTTTATCCAGCCCTCAC |
含大肠杆菌araBAD 启动子载体 (F-primer) | ATGCCATAGCATTTTTATCC |
含大肠杆菌araBAD 启动子载体 (R-primer) | GATTTAATCTGTATCAGG |
pBluescript载体 (F-primer) | TCGAGGTCGACGGTATC |
pBluescript载体 (F-primer) | TCTAGAACTAGTGGATC |
pBMN 载体 MMLV序列 | GCTTGGATACACGCCGC |
pBR322 载体的ori引物 (F-primer) | GGGAAACGCCTGGTATCTTT |
pBR322载体BamHI位点上游序列 (F-primer) | CTTGGAGCCACTATCGAC |
pBR322载体EcoRI位点上游序列 (F-primer) | AATAGGCGTATCACGAGGC |
pBR322载体BamHI位点下游序列 (R-primer) | GGTGATGTCGGCGATATAGG |
pCAG载体兔β-珠蛋白内含子引物 (F-primer) | GCAACGTGCTGGTTATTGTG |
pCasper载体果蝇微白基因引物 (R-primer) | GGGTTTTATTAACTTACAT |
pCasper载体Hsp70启动子引物 (F-primer) | GCAACTACTGAAATCTGCCAAG Drosophila Hsp70 promoter, forward primer |
pcDL载体EcoRI位点5’端 (F-primer) | GTTGCCTTTACTTCTAGGCCT |
pENTR载体的attL1 5’端 (F-primer) | CTACAAACTCTTCCTGTTAGTTAG |
pENTR载体的attL2 3’端 (R-primer) | ATGGCTCATAACACCCCTTG |
pGEX 载体多克隆位点的3'端序列 (R-primer) | CCGGGAGCTGCATGTGTCAGAGG |
pGEX 载体glutathione-S-transferase 3’端序列 (F-primer) | GGGCTGGCAAGCCACGTTTGGTG |
pGP704载体R6K gamma origin引物 (R-primer) | AACAAGCCAGGGATGTAACG |
pHybLex 载体ADH terminator引物 (R-primer) | GAGTCACTTTAAAATTTGTATACAC |
pL启动子载体 (F-primer) | ACTGAGCACATCAGCAGGAC |
pLXSN 载体 (F-primer) | CCCTTGAACCTCCTCGTTCGACC |
pMT2载体 (F-primer) | TTGCCTTTCTCTCCACAGGT |
pMX-S1811载体的MMLV序列 (F-primer) | GACGGCATCGCAGCTTGGATACAC |
含Polyhedrin 启动子载体 (F-primer) | AAATGATAACCATCTCGC |
含Polyhedrin 启动子载体 (R-primer) | GTCCAAGTTTCCCTG |
pQE 载体 (F-primer) | CCCGAAAAGTGCCACCTG |
pREP 载体 (F-primer) | GCTCGATACAATAAACGCC |
pRS载体的酵母选择标记序列 | CGGCATCAGAGCAGATTGTA |
PZ P-element (R-primer) | CTTAGCATGTCCGTGGGGTTTGAAT |
pTrcHis 载体 (F-primer) | GAGGTATATATTAATGTATCG |
pTrcHis 载体 (R-primer) | GATTTAATCTGTATCAGG |
嘌呤霉素3’端基因序列 (F-primer) | GCAACCTCCCCTTCTACGAGC |
pZIP载体 (R-primer) | TCCTTTCCAGCGAGGTTCTA |
RSV基因3’端序列 (F-primer) | ACATGGGTGGTGGTATAGCGCTTGCG |
海肾荧光素酶基因3’端序列 (F-primer) | CCAGGATTCTTTTCCAATGC |
pGL3 载体 (F-primer) | CTAGCAAAATAGGCTGTCCC |
SP6启动子载体 (F-primer) | ATTTAGGTGACACTATAG |
SV40 polyA引物 (R-primer) | GAAATTTGTGATGCTATTGC |
SV40启动子载体 (F-primer) | TATTTATGCAGAGGCCGAGG |
SV40-splice序列 (R-primer) | CACAAAGATCCGGACCAAAG |
T7 终止子引物 (R-primer) | GCTAGTTATTGCTCAGCGG |
Tac 启动子载体 | GAGCGGATAACAATTTCACACAGG |
tdTomato 3’端序列 (F-primer) | CTGTTCCTGTACGGCATGG |
tdTomato 5’端序列 (R-primer) | TCTTTGATGACGGCCATGT |
四环素抗性基因5’端序列 (R-primer) | GGCGAGTTTACGGGTTGTTA |
Thymidine kinase polyA引物 (R-primer) | TTGTCTCCTTCCGTGTTTCA |
Tn7转座子引物 | GGGGTGGAAATGGAGTTTTT |
哺乳体系载体含U6启动子型 (F-primer) | CAAGGCTGTTAGAGAGATAATTGGA |
Ubx基因引物 (F-primer) | AACTCGTACTTTGAACAGGC |
V5 表位基因引物 (R-primer) | ACCGAGGAGAGGGTTAGGGAT |
WPRE 5’端引物 (R-primer) | CATAGCGTAAAAGGAGCAACA |
XBG 3'UTR (R-primer) | GACTCCATTCGGGTGTTC |
XEF1a增强子/启动子引物 (F-primer) | TTTCGCCCTAACTTCGTGAT |