Co-IP技术服务案例
1、实验设计
用预先固化在argarose beads上的Protein A的抗体免疫沉淀A蛋白,与A蛋白在体内结合的蛋白质B也能一起沉淀下来。再通过蛋白变性分离,对B蛋白进行检测,进而证明两者间的相互作用。
2、试剂和耗材
样品:(1). HEK293未转染细胞
(2). 对照组pcDNA3.1-flag +pcDNA3.1-xx
(3).实验组pcDNA3.1-3D-Flag+pcDNA3.1-xxx
名称 | 公司 | 名称 | 公司 |
---|---|---|---|
抗体:Flag,cMyc | 钟鼎生物 | Protein Marker | 钟鼎生物 |
Acr、Bis、Tris | Sigma公司 | SDS | Amresco公司 |
TEMED | BIO-RAD公司 | 其它试剂均为国产分析纯 |
3、主要实验仪器
仪器名称 | 公司 | 仪器名称 | 公司 |
---|---|---|---|
Allegra 21R 台式高速冷冻离心机 | 美国BECKMAN公司 | 台式高速离心机 | 德国SORVAL公司 |
Gel Doc2000成像系统、垂直电泳系统 | 美国BIO-RAD公司 | 320-S pH计 | 美国Mettler Toledo公司 |
AR5120电子天平 | 美国AHOΜS公司 | MultiTemp III 恒温水浴锅 雪花状制冰机 | 日本SANYO公司 |
超净工作台 | 中国苏净集团 | NANODROP2000 | Thermo公司 |
4、实验步骤
4.1、样品制备
(1) 取样品依次加入适量的裂解液混匀,在冰上充分裂解。
(2) 将细胞裂解液转移到 1.5 ml EP管内,于冷冻离心机 4℃,12000 rpm 离心 10 min。
(3) 将离心后的上清液分为两份:一份 40 μl,加入10 μl 5×SDS sample buffer, 混匀后于100℃煮 10 min,作为总细胞裂解液于-20℃保存,Western blot 检测目的蛋白的表达水平。
4.2、免疫沉淀
(1) 各取30 μl Protein A置于离心机2000 rpm 弃上清,在用PBS洗涤2次。加入300 μl细胞裂解液4度旋转仪4h(消除样品中非特异性结合的影响)。
(2) 4℃,4000 rpm 离心 5 min,弃去沉淀,保留上清。
(3) 上清中加入已经平衡10 μl 抗体A,置于4℃旋转仪上旋转4 h,让抗原a和抗体A充分结合。
(4) 加入30 μl已经平衡好的 Protein A置于4℃旋转仪上旋转4 h,让抗原a和抗体A复合物与protein A充分结合。
(5) 离心,弃上清。沉淀用PBS洗3遍。
(6) 用PH1.5甘氨酸50 μl在冰上洗脱混匀20 min。
(7) 离心10000 rpm 2 min取上清为免疫复合物洗脱液,加入5×SDS sample buffer混匀后 100℃煮10 min。用于后续SDS-PAGE电泳或Western blot检测。
4.3、Western Blot 检测
(1) 取总细胞裂解液,加loading buffer煮沸冷却后上样。
(2) 电泳条件:4%浓缩胶:90 V, 30 min; 15%分离胶:120 V, 90 min。
(3) 电泳结束后,取下凝胶进行转膜,恒流250 mA转膜,约为1h。
(4) 电转结束后,取下膜后先用PBST洗涤4次,每次5 min。
(5) 将膜置于5%脱脂奶粉封闭液中封闭37℃ 1 h。
(6) 用PBST稀释一抗,膜在一抗稀释液中4℃过夜。
(7) 次日将膜取出后用PBST 洗膜4次,每次5 min。
(8) 用含5%脱脂奶粉的封闭液稀释二抗。膜在二抗中37℃反应1 h。
(9) 反应完毕后,把膜取出后置于干净的盒子中洗膜4次,每次5 min。
(10) ECL显影,曝光。
5、实验结果
编号 | 抗体名称 | 稀释比例 | 二抗名称 | 稀释比例 |
---|---|---|---|---|
1 | Flag | 1:1000 | 羊抗鼠 | 1:5000 |
2 | cMyc | 1:5000 | 羊抗鼠 | 1:5000 |
蛋白互作验证
用预先固化在argarose beads上Flag的抗体免疫沉淀带Flag标签的B蛋白,那么与A蛋白在体内结合的蛋白质B也能一起沉淀下来。再通过蛋白变性分离,对B蛋白所带标签GFP进行检测,进而证明两者间的相互作用
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