纳米抗体相较于传统抗体,具有显著优势,如更低的免疫源性和更佳的组织渗透性。然而,构建纳米抗体免疫库却是一项耗时耗资的工作。免疫周期通常需要长达3至4个月的时间,且饲养羊驼作为抗体来源的成本也相当高昂。这些高门槛使得许多实验室对纳米抗体的研究望而却步。但随着抗体库技术的不断突破,现在已有了纳米抗体合成库这一替代方案,它为我们规避了动物免疫的繁琐过程,为纳米抗体的研究开辟了新的道路。
1、噬菌体载体构建
采用的纳米抗体骨架序列区来自公司构建的羊驼来源、性能良好的天然纳米抗体文库所对应的骨架序列。通过对天然纳米抗体文库的大规模测序,确定了骨架区序列。采用重叠PCR的方法,设计简并引物,扩增获得VHH区,并构建至噬菌粒载体pComb3XTT中,与gene III蛋白融合表达。
图1 噬菌粒pComb3xtt质粒图谱
图2 全合成纳米抗体文库PCR示意图
2、全合成纳米抗体文库的质量鉴定
1)全合成纳米抗体文库库容的鉴定: 2.95×1011
2)VHH 片段插入率的检测 :100%
3)VHH片段插入正确率和多样性检测:插入成功率>80%,随机测序的序列均为unique序列,文库的多样性良好。
淘选数据
Round | Conditions | Input | Output | Output(pfu) | Enriching factor |
C(1st input)=3.00×1012pfu/ml | |||||
1st-P | Target protein:抗原蛋白(5 μg/mL),一板 Blocking: 文库与2% Milk-PBST反应1h;包被的板子与2% Milk-PBST封闭1h 预吸附:封闭后的文库与封闭后的空板预吸附1h;吸附:取上清,与包被了抗原蛋白 (5 μg/mL)的板子吸附1h Washing: 0.1% Tween20-PBS, 15 times Elution: 0.1M Glycine-HCl, pH2.5,elute15min Neutralization: 1M Tris-HCl |
1.00×1013 | 2.00×106 | 2.88×107 | 3.47×105 |
C(2nd input)=3.00×1012pfu/ml | |||||
2nd-P | Target protein:抗原蛋白(5 μg/mL),一板 Blocking: 文库与2% Milk-PBST封闭1h;包被抗原的板子与2% Milk-PBST封闭1h 预吸附:封闭后的文库与封闭后的空板预吸附1h; 吸附:取上清,与包被了抗原蛋白 (5 μg/mL)的板子吸附1h Washing: 0.1% Tween20-PBS, 15 times Elution: 0.1M Glycine-HCl, pH2.5,elute15min Neutralization: 1M Tris-HCl |
6.00×1012 | 1.00×107 | 1.44×108 | 4.17×104 |
C(3rd input)=3.50×1012pfu/ml | |||||
3rd-P | Target protein:抗原蛋白(5 μg/mL),一板 Blocking: 文库与2% Milk-PBST封闭1h;包被抗原的板子与2% Milk-PBST封闭1h 预吸附:封闭后的文库与封闭后的空板预吸附1h; 吸附:取上清,与包被了抗原蛋白 (5 μg/mL)的板子吸附1h Washing: 0.1% Tween20-PBS, 15 times Elution: 0.1M Glycine-HCl, pH2.5,elute15min Neutralization: 1M Tris-HCl |
6.00×1012 | 5.00×107 | 7.20×108 | 8.33×103 |
Phage ELISA 散点图:
抗体纯化图
纯化抗原亲和力检测
基于Biacore T200系统,对纯化后的抗原进行亲和力检测,结果如下所示: