选择合适多肽片段对于获得能与天然抗原发生交叉反应的抗体是至关重要的。本文介绍了免疫原性多肽及其载体的选择，供大家参考。

    对于选择免疫原性多肽，目前最常用的做法是选择一个10~15个氨基酸残基的多肽，该多肽对应于这种蛋白质抗原的C端或N端序列，然后采用化学交联的方法将这个肽连接到一个载体分子上，如KLH或者牛血清白蛋白(BSA) 等。然而，如果所需的肽序列位于蛋白质序列的中间，那么这个肽段的选择就要采用预测潜在抗原位点的一些算法。这些预测方法则建立在亲水性预测或者二级结构预测等方面。目的是要使这种蛋白质的备选区域具备以下条件之一:

①表面暴露，如某个亲水区域;

②相对于其余结构的构象灵活，如环区或预测形成β转角的区域。化学偶联过程可以把肽结合到载体蛋白质上，然而它却可以使预测选择受到偶联的化学原理的制约。

一.羧基端多肽的选择

    C端肽的原因是因为蛋白质的C端肽活动性较其他部分更强，且这个肽可以用戊二醛直接偶联在载体蛋白上。偶联的肽通过其氨基端偶联到载体上，这种偶联方式与所发现的天然抗原的方式很相似。然而，这种方法首先必须排除肽内碱性氨基酸的存在。

二.氨基端多肽的选择

    氨基端具 有与前述羧基端同样的优点，但也有缺点，它有可能会发生翻译后的乙酰化修饰，或前导序列被去除。将含有C端半胱氨酸的N端肽偶联到载体上去。最好用MBS来完成。

三.位于序列中间的肽段的选择

    从序列的中间部分选择肽序列， 需要利用各种算法预测该区域是否具有抗原性。唯一需要得到的资料即是其序列的一级结构。

四.自体蛋白

    如果要 寻找的抗原是哺乳动物源性的，将此抗原的序列与要被免疫的动物的该蛋白质的序列进行比较，常能得到重要的信息。只有那些序列不同的区域才最可能具有免疫原性。如果同源蛋白的免疫原性是已知的，那么在所研究的蛋白质中，可以选择一个相似的区域作为合成肽免疫原。

五.载体的选择

    载体分子的最为重要的要素是它在进行化学偶联后具有可溶性以及有大量的赖氨酸以供偶联，使用最多的载体是KLH及BSA, KLH的优点在于它具有很强的免疫原性，而BSA则具有很好的可溶性。

六.多肽的合成

    多肽的合成中最为重要的参数是要确保所合成的多肽与天然的抗原尽可能相似，在进行N端封闭抗原的N端肽的化学合成时，需要将a氨基乙酰化，乙酰化作用也提供了将示踪同位素掺人到肽里的机会，这对于定量检测交联到载体分子上的多肽的数量可能很重要。如果需要位于中间的肽序列，那么，应对游离的a氨基和a羧基进行修饰，以模拟天然抗原。在偶联过程中其一端将被封闭， 但另-端必须进行修饰。

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