单细胞ATAC-seq（scATAC-seq）将单细胞技术和ATAC-seq进行结合的能够在单细胞层面探索染色质开放性的有效方法。

经典研究转录因子/蛋白复合物与DNA结合的方法是ChIP-seq，该方法虽然能够准确鉴定蛋白与DNA结合的区域，但一个实验一次只能鉴定一个转录因子/组蛋白的DNA信息，无法满足大通量研究基因转录调控的需求。而单细胞层面的scATAC-seq可以批量检测染色质的开放程度，结合生信分析鉴定转录因子结合位点，可以在DNA水平系统研究基因的转录调控。

实验流程

在这项技术中，细胞核悬液经过Tn5转座酶反应，切下染色质开放区。细胞核，带有barcode序列的gel beads和油滴分别投入到微流控芯片中形成油包水结构。线性扩增后，同一细胞核内的片段被加上相同的barcode序列，然后经过PCR扩增加上测序接头，构建成文库进行高通量测序。

分析流程

服务详情

单细胞ATAC-seq服务详情
客户提供	项目内容	周期	价格
1、样本类型:单细胞核悬浮液 2、样本来源:细胞系、原代细胞、冷冻保存样品 3、细胞核大小:小于40μm 4、数据量:推荐每个细胞核测25M reads	1、单细胞ATAC-SEQ 2、生物信息学分析	视项目具体情况而定	在线询价

项目经验-动物

项目经验-植物